1646年10月，豪格經過五個月的戰鬥，背靠著優勢兵力，終於消滅瞭盤踞在漢中的賀珍軍的主力，不久後賀珍被迫逃往夔東，孫守法退守石子城，而伴隨著漢中的平定，豪格部也在此時正式踏入瞭巴蜀。而與之相比，大西軍此時已是一盤散沙，張獻忠聽聞豪格前來，便決定徹底放棄四川，並在臨走前焚毀瞭成都，而這一舉動再加上此前的暴政，更是讓大西軍流言四起，最終使得大量川籍士兵逃離，張獻忠的麾下大將劉進忠也向豪格投降。十一月二十六日，豪格從大西軍俘虜中得知張獻忠駐紮在西充，便密令鰲拜率精銳為先鋒，自己則帶大軍隨後進發。二十七日，清軍抵達西充鳳凰山。而此時的西軍已毫無戰力，即使清軍迫近，張獻忠仍舊沒有準備，直到清軍近在眼前時，張獻忠才帶著少數隨從出營查看，最終被清軍射殺。

而隨著張獻忠終於死瞭，西軍的戰鬥力也奇跡般地恢複瞭，張獻忠死後，孫可望收攏著殘兵敗將殺向重慶，竟一舉將明軍守將曾英擊殺。1647年正月初一，孫可望在整頓完大西軍後，於綦江宣佈：“自今非接鬥，不得殺人。”接著便率領重獲新生的軍隊進入遵義，一路上秋毫無犯。而此時，艾能奇也向張獻忠的幫兇、宰相汪兆齡發難道：“昔老萬歲在成都，汝為宰相，不能輔之治國，惟勸之殺人，以至人心危懼，不肯順從。天下俱名我輩為賊，今日惶惶無之，汝尚欲我輩複作賊耶？”並最終處決瞭汪兆齡。隨後，衆人推舉孫可望為首領，經貴陽、安順擺脫瞭豪格部的追擊，來到瞭彩雲之南，在雲滇落腳後，孫可望一轉立場，打出瞭“共扶明後，恢複江山”的旗號，與當地的明軍聯手，擊敗瞭常年割據於雲南的沙定洲勢力，隨後進駐昆明。自此，孫可望、李定國的大西軍，乃至整個南明，也終於翻開瞭新的一頁。而這，就是另一個故事瞭……

大結局

“青青……青青……”

“宛兒？是你？”

隨著一聲虛弱而久違的聲音傳來，一幕原本隻存在於想象中的場景就這樣出現在瞭青青的面前，經過瞭幾年的離別，眼前的宛兒已是透著疲態，然而不論經過多少的風霜，當二人相遇的那一刻時，她們又仿佛一下子便回到瞭從前的模樣。

“宛兒，快坐下，我來幫你療傷。”

“……青青。”

未等宛兒分說，青青僅是看著宛兒的樣子，便已明白瞭現在的當務之急，宛兒見此也靜靜地坐瞭下來，什麼都不再去想……

為宛兒初步治完傷後，二人這才互相瞭解起這幾年的過往，原來自從宛兒的部衆被打散後，宛兒便拖著重傷的軀體隱匿在一艘船中，並最終跟隨者船隻來到瞭京師，而在整個京師，溫青青則是她唯一能仰仗的人。然而盡管宛兒在溫青青的房間裡暫時安頓瞭下來，但由於溫青青自身也一直處於清廷的監視之下，一直將宛兒藏匿於自己屋內總會有露餡的一天，於是青青便想著將宛兒偷偷送到城外。

而與此同時，攝政王多爾袞也在逐步開始他的稱帝計劃，為瞭增強自身的實力並削弱忠於皇帝的勢力，多爾袞先是將濟爾哈朗、鰲拜等忠臣下獄，並為自己手下的兩白旗與正紅旗大肆圈地，而這也引起瞭孝莊太後的警覺，二人的矛盾逐步公開化。

而另一邊，就在青青與宛兒即將出城的時候，二人的身份卻最終還是暴露瞭。於是，東莪為瞭抓捕二人，便動用瞭睿親王府的兵馬，此時二人已是插翅難逃，但就在這時，南宮黎卻以“八旗軍隊當遵皇帝之命，多爾袞私自調兵等同篡逆”為由，說動瞭孝莊太後，就這樣，東莪的兵馬被皇帝的勢力堵在瞭半路上，溫青青與焦宛兒在南宮黎等人的幫助下最終得以出城。

到瞭城外，南宮黎說山西偏關總兵萬練一直心向明朝，並讓青青投靠他，然而青青卻說萬練官職低微，根本不具備陰養死士的實力，情報顯示他能陰養死士，說明他的背後一定還有更大的人物在資助。而如今青青與宛兒已經成為瞭清廷的通緝犯，若是直接去找萬練恐怕會讓山西整個的反清勢力都因此暴露，於是最終拒絕瞭南宮黎的建議。隨後，二人北上至蒼穹派，由於青青握有蒼穹派的把柄，再加上蒼穹派掌門並非完全向著清朝，因此最終在蒼穹派的隱匿下，二人也逃到瞭北方大漠，隨後二人沿著大漠一路西行至西域，並最終在暗弱的吐魯番汗國安頓瞭下來。而烏雅明軒與雲霞的謎團，原本也是想在吐魯番汗國中慢慢揭曉的，但現在也隻能留給觀衆想象瞭。青青與宛兒也最終在處理完所有事情後，在西域度過瞭安穩的下半生。