所以刘衍还是决定采取稳妥的办法，分两步走，先用新政、军改之策强力控制地方，然后再推行改土归流之策。

而此番铲除那些参与叛乱的土司，算是提前预演。有叛乱之罪这个说辞，其他未参与叛乱的土司也说不出什么来，只会说那些被裁撤的土司是咎由自取。

很快，西南巡视组和临时巡视组进驻两广、云贵，开始对各地进行整顿，同时数以百计的文官武将被捉拿，两广云贵各地都能见到抄家的兵马，大批的犯官及家眷被锁拿回京，大批的钱粮被收缴，除了一部分用于各地重建，以及新政、军改之策的消耗外，剩下的查抄钱粮全部运回了北京城，由财政部登记入库。

这场动荡只持续了一个月左右的时间，但是动静却非常之大，在刘衍的要求下，朝廷直接借此机会对两广、云贵的文官武将进行了大清洗，杀死、抄家、判刑者甚众。

同时，朝廷从北方各省，以及各地新式学校、皇明军事学院、皇明演武堂的优秀毕业生中，抽调了大量的人才进入两广和云贵为官，基本上将广东、广西、云南、贵州的官吏换了一遍。

转眼到了十月中旬，刘衍收到参谋部汇总的奏报，得知南方巡视组、临时巡视组会同各地的驻防军，对两广、云贵的文官武将进行大清洗，目前已经接近尾声。

此番共有三十八名犯官直接参与了叛乱，被公诉部判处诛杀三族的判决，还有两百九十八名犯官被判斩立决，另外有一百一十六人被判刑，七十三人被罢免。

报到朝廷的数字中，此番斩杀的犯官及家眷，还有被杀的俘虏等，一共有一万三千多人，朝廷抄家所得财物，折合银币足有两千七百余万两。

看到这些数字，刘衍心中依旧怒不可遏，就连云贵这样偏远的省份，都能从官吏家中抄出如此众多的财物，可见大明原本的吏治腐败到了何等的地步！

如果不是及时在大明各地落实新政之策，将大明官场的贪腐压缩在一个可控的程度内，天知道此时的大大明会是一个什么样子。

刘衍心中松了一口气的同时，也开始谋划接下来的福建之行了。

“郑芝龙所部必须妥善安置，整编为驻防军显然是不合适的，看来国防军的编制又要增加了！”

按照此时大明的军制，不管是装备还是军饷、补给，国防军都要优于驻防军。而且即便是同级别的军官，比如是各总兵官，国防军的总兵官也要比驻防军级别高，因为刘衍规定：所有驻防军的总兵官全都是挂将军印的，而驻防军的总兵官则是不挂印。

所以刘衍便考虑将郑芝龙部兵马整编为国防军，以优厚的待遇，将这二十多万大军调离福建。

就在刘衍思索具体细节的时候，王承恩却突然来到内阁官署宣旨。

第五百九十八章 这就是代价

勤政殿内，崇祯帝正在翻看近期内阁报送过来的各种奏章，其中关于平定两广、云贵叛军事务，以及各地新政、军改落实事务的奏章占了大多数。

崇祯帝见到刘衍对两广、云贵的文官武将进行了大清洗，杀戮甚多，心中很是不满，虽然明知那些官吏几乎是无人不贪，很多人都或多或少的与叛军有关联，崇祯帝对于这些官吏也非常痛恨，可是刘衍趁机将四省官吏全部替换了一番，更让崇祯帝心中不痛快。

此时刘衍就站在旁边，崇祯帝翻看完毕之后，便看向刘衍，略带不满的说道：“刘阁老这么做，杀戮太深了，长此以往，我大明岂不是要走上暴秦的道路了！”

刘衍说道：“陛下明鉴，有些人是不杀不行的，不杀则不足以平民愤，不杀不足以整肃朝纲！”

崇祯帝眉头紧锁，说道：“可是按照刘阁老这么干下去，就不是改革了，而是要全盘推翻我大明的各项国策。就好比卫所制，当年太祖皇帝立下卫所制，国家养兵百万而不费百姓一粟，可是现在刘阁老推行的军改，却几乎将卫所制废除，是不是太过了！”

刘衍说道：“陛下，我大明的卫所制与户籍制严密挂钩。当年太祖皇帝分天下百姓为民、军、匠等户，每户职业世袭，此举本就有很大的弊端。所以卫所兵源即为世袭的军户，卫所制下，军队平常务农，战时做战。但世袭的军功制使卫所各级将领逐渐发展为当地的豪强，各地的卫所军户则沦为了他们的附庸农民，使我大明的军队只知农耕而不知军事，造成全国兵马战力普遍下降。”

崇祯帝闻言很是不满，隐约有了爆发的迹象，一旁的王承恩不断以目示意，让刘衍说话注意点，可是刘衍却视而不见。